研究

研究は、大きく分けて生体物質などの複雑な古典系の分子動力学(MD)シミュレーションと、核の運動が量子化されている量子動力学シミュレーションの二本立てですが、次世代スパコンプロジェクトの関係で、64万コアにも及ぶ次世代スパコンの性能をフルに活用できるMD計算ソフトの開発も行っています。


  1. 自己組織化により形成された水中の分子集団系の分子動力学計算
    1. ミセルの分子論
    2. 生体膜
    3. ウイルスの全原子シミュレーション
  2. 量子化された系の計算機シミュレーション
    1. 溶液系・生体分子におけるプロトン移動の量子動力学
    2. 溶液系における分子振動量子動力学
  3. ソフト開発
    1. 高並列汎用分子動力学シミュレーションソフト modylas
    2. 初期構造生成ツール NANO-IGNITION